硕博论文查重与知网查重的主要区别在于其检测范围和原理。硕博论文查重通常指的是通过专业的查重软件对学术论文进行查重，主要检测文本与互联网、数据库中的文献是否存在相似内容。而知网查重是指利用中国知网数据库进行查重，主要检测文本与知网数据库中的文献是否存在相似内容。因此，硕博论文查重更加广泛，而知网查重更加专业。

此外，硕博论文查重与知网查重在使用方面也有所不同。硕博论文查重通常需要购买或使用学校提供的专业查重软件，用户可以自行上传论文进行查重。而知网查重则需要在中国知网平台注册账号，通过在线提交论文进行查重。因此，硕博论文查重更加灵活，而知网查重更加便捷。